相传闽王延政天德年间（943-945年），有一高僧云游到闽中重镇虬城。一日黄昏，夕阳西下，无意中望见城郊西北方向绵绵群山间，祥云缭绕，金光四射，有如千佛跃动，一时激动万分，认定此为一处佛门胜地，便广为化缘，在山中修建了一座颇具规模的庙宇，这就是闽中八大丛林之一的栖云寺。
栖云寺，坐落于虬城西北4公里外的怡山山麓，出县城西，沿往三姑、垄东公路上山2公里，就在去水美古堡的路上，转入一条林木掩映的便道，前行百米就可抵达栖云寺。宋建隆三年(962年)重建。清康熙元年(1662年)重修。原有前殿、正殿、后殿、钟鼓楼、方丈室、藏经室、静坐厅等建筑。民国26年被内迁省政府保安处军械所占用。1966年“文化大革命”中被拆毁。1984年重建，现已修复正殿、厨房、宿舍等，新建面积约900平方米，幸存古代石狮2座，寺钟1口，石碑2方。
栖云寺以“三宝”著称：古树（一棵巨大的枫香）、银狮（天王殿门口台阶上那对石狮）、碑刻（保存在大雄宝殿后的两块残碑）。
